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2022.01.07
一个都不能少 | 融合基因捕捉利器——“RNA-NGS”检测

染色体重排所导致的基因融合是肿瘤中的常见现象,在肿瘤的发生过程中起着非常重要的作用。精准检测融合基因不但可以协助临床医生对肿瘤进行诊断和分型,还能够为后续的治疗提供必要信息。


近日,臻和的科技与战略合作副总裁王海波博士在重庆市医学会病理学分会学术年会上,分享了题为《RNA-NGS在肿瘤精准诊疗中的实践》的主旨报告。从“融合基因的存在、检测的重要性、RNA-NGS技术的检测优势、真实世界的案例研究和大规模队列研究”等方面,剖析了RNA-NGS检测融合基因的大有可为。


王博士在报告中介绍到,融合基因检测已被纳入多个癌种的NCCN诊疗指南,如非小细胞肺癌、结直肠癌、肝胆肿瘤等。相对于基因突变来说,融合频率相对较低,但对应靶向药物的疗效显著,由此,基因融合逐渐成为肿瘤治疗的重要药物靶点。


在以往的融合基因检测中,荧光原位杂交(FISH)、免疫组化(IHC)等方法的灵敏度和通量通常较低,还较为依赖检验人员的主观判断经验,且往往只适用于已知的融合亚型,应用拓展有限。而基于RNA-NGS的检测技术,可以全面检测所有融合形式,有可能发现更多的治疗机会。


同时,与DNA-NGS检测相比,RNA-NGS检测能提升融合检出率,降低假阴性。


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Davies KD, Aisner DL. Clin Cancer Res. 2019, 25(15):4586-4588.

doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-1361.


在随后的案例分享中,王博士解读了一例基于RNA-NGS检出ALK复杂结构融合(DNA-NGS未检出),经阿来替尼治疗有效,DFS>14个月的真实数据。


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DNA-NGS难以检出的原因:两个融合基因之间插入一段基因间区(序列较长)。在RNA层面,由于基因间区不表达,所以可以直接检测到经典的EML4-ALK。


在采用臻和容适博®️产品开展的一个真实世界大规模队列的研究项目中可以看到:

1-DNA-NGS检出在入组实体瘤患者中(肺癌占比超过76%),融合阳性患者占比10.2%;RNA-NGS将融合阳性患者检出率提升到13.4%。

2-近30%的融合患者采用DNA-NGS检测手段无法检出,只能利用RNA-NGS方法来充分鉴别。

3-在靶向药的匹配性上,RNA-NGS检测方法可以使得真实世界里面近50%的融合阳性患者,重新获得靶向治疗的获益机会,显示出了它作为DNA-NGS检测方法的高效补充。

4-超过10%的DNA-NGS驱动基因阴性肿瘤患者,可以通过RNA-NGS检测到有临床意义的融合/重排。

5-超过20%的DNA-NGS驱动基因阴性肺腺癌患者,可以通过RNA-NGS检测到有临床意义的融合/重排。

6-在ALK、ROS1、RET、METexon14、NTRK、FGFR等重要融合基因的检测中,相较于DNA-NGS,RNA-NGS都展现了显著的优势。


21.3% 的 DNA panel 驱动基因阴性肺腺癌患者可通过 RNA panel 检测到有临床意义的融合/重排:

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从王博士的报告中,大规模的真实世界数据研究显示了,RNA-NGS技术能够更精准的检测各种形式表达的基因融合,无论是经典还是非经典的基因融合,让更多的患者获得用药的机会,从而临床获益。那么,如何做到融合检出“一个都不能少”呢?


臻和特别推出的“臻容致远”项目,结合了“DNA-NGS、RNA-NGS”并行检测,最大化检出融合事件,不遗漏靶向治疗机会。


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相信这一联合检测方式,将进一步提高肿瘤融合基因检测的精准度,为患者的诊断和治疗带来更多福音。

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